مدرستي
Sciences de la nature et de la vie🎓 objectif bac

العلاقة بين بنية ووظيفة البروتين تمثيل البنية الفراغية للبروتين

البنية الفراغية للبروتينات و مستوياتها الأربعة

🔊 La maîtresse lit pour toi
إشكالية: رأينا كيف تُترجَم المعلومة الوراثية إلى تتابع من الأحماض الأمينية مرتبطة بروابط ببتيدية، غير أنّ البروتين داخل الخلية ليس خيطا ممدودا بل جسم له شكل في الفضاء، ولكلّ بروتين وظيفة تخصّه. فكيف نمثّل هذا الشكل الفراغي، وما مستويات تعقيده، وما الذي يحافظ على تماسكه في كلّ مستوى ؟
🎓في نهاية هذا الدرس ستكون قادرا على:
  • أن تقارن بين نماذج تمثيل البنية الفراغية وتستخرج ما يُظهره كلّ نموذج
  • أن تعلّل لماذا يُفضَّل النموذج الشريطي في دراسة بنية البروتينات
  • أن تصف مستويات البنية الفراغية الأربعة وتربط بينها
  • أن تسمّي الروابط التي تثبّت كلّ مستوى وتصنّفها حسب قوّتها
  • أن تستخرج أوجه التشابه والاختلاف بين أربعة بروتينات شائعة
🔑يفترض هذا الدرس أنّك تتقن:
  • أنّ البروتين سلسلة من الأحماض الأمينية مرتبطة فيما بينها بروابط ببتيدية
  • أنّ تتابع الأحماض الأمينية في البروتين تحدّده المعلومة الوراثية للمورثة
قبل أن تبدأ، افهم الفرق بين شيئين يُخلط بينهما دائما: النموذج والبنية. البنية هي الجزيء كما هو في الواقع، والنموذج طريقة في رسمه تُظهر بعض جوانبه وتخفي أخرى. فحين نقول إنّ نموذجا «أفضل» فنحن لا نعني أنّه أصدق، بل أنّه يُظهر ما نبحث عنه نحن في هذه اللحظة.

النشاط 1: نماذج تمثيل الجزيئات — من الحمض الأميني إلى البروتين

الوثيقة ⁦(1)⁩: طرائق تمثيل البنية الفراغية، على حمض أميني ثمّ على بروتين.
🎯التعليمة
  1. قارن بين نماذج تمثيل الألانين، وحدّد ما يُظهره كلّ نموذج منها.
  2. بيّن ما يحدث لهذه النماذج نفسها حين تُطبَّق على جزيء كبير مثل البروتين.
  3. استخرج ميزة النموذج الشريطي، وعلّل لماذا هو الأكثر استعمالا في دراسة البروتينات.
إظهار الإجابة
🔍التحليل
  1. نقارن ونحدّد: الصيغة المفصّلة تُظهر الذرّات والمجموعات الوظيفية والروابط بينها. ونموذج الكرة والعود يُظهر أنواع الذرّات المكوّنة وترتيبها في الفضاء. والنموذج المكدّس يُظهر الحجم الجزيئي والحيّز الذي يشغله الجزيء فعلا. ونموذج العود يُظهر الهيكل وحده دون حجم الذرّات. فكلّ نموذج يجيب عن سؤال غير الذي يجيب عنه غيره.
  2. نبيّن ما يحدث مع البروتين: تصير النماذج الذرّية الثلاثة غير مقروءة. فالنموذج المكدّس يعطي كتلة مصمتة لا تفصيل فيها، ونموذجا الكرة والعود والعود يعطيان شبكة متشابكة يُحسّ فيها الانطواء ولا يُرى تنظيمه. والسبب أنّ عدد الذرّات صار بالمئات، فما كان يوضّح جزيئا صغيرا صار يحجب جزيئا كبيرا.
  3. نستخرج الميزة ونعلّل: النموذج الشريطي يفعل العكس، فهو يحذف الذرّات ولا يُبقي إلّا مسار السلسلة. وبهذا الحذف تظهر دفعة واحدة البنيات الثانوية الحلزونية والوريقية ومناطق الانعطاف التي تصل بينها، ويصير من الممكن مقارنة بنيتين فراغيتين بالعين. ولهذا هو الأكثر استعمالا في دراسة البنية الفراغية للبروتين.
الاستنتاج: لكلّ نموذج ما يُظهره: الكرة والعود والنموذج المكدّس يُظهران أنواع الذرّات والحجم الجزيئي، والنموذج الشريطي يُظهر البنيات الثانوية ومناطق الانعطاف. ولأنّ البروتين جزيء كبير فإنّ النموذج الشريطي وحده يبقى مقروءا، ولذلك هو المعتمد في دراسة بنيته الفراغية.

النشاط 2: البنيات الثانوية كما يُظهرها الحاسوب

الوثيقة ⁦(2)⁩: البنيات الثانوية ممثّلة بالحاسوب باستعمال برنامج راستوب.
🎯التعليمة
  1. صف الشكل الذي تأخذه البنية الحلزونية والشكل الذي تأخذه البنية الوريقية في النموذج الشريطي.
  2. حدّد ما يمثّله الخيط الأبيض الذي يصل بين هذه البنيات.
  3. استخرج ما يضيفه استعمال برنامج راستوب إلى دراسة بنية البروتين.
إظهار الإجابة
🔍التحليل
  1. نصف الشكلين: تُرسم البنية الحلزونية α شريطا ملتفّا على نفسه التفافا منتظما، وتُرسم البنية الوريقية β شريطا مسطّحا عريضا ينتهي برأس سهم يدلّ على اتّجاهه، وبه تُميّز الوريقات المتوازية من المتعاكسة. فالبنية الثانوية تُقرأ إذن بشكل الشريط لا بلونه.
  2. نحدّد الخيط الأبيض: هو المناطق البينية، أي مناطق الانعطاف. وهي أجزاء من السلسلة الببتيدية ليس لها شكل فراغي محدّد، تُرسم عادة خيطا رفيعا أبيض، وتصل بين بنية ثانوية وأخرى.
  3. نستخرج ما يضيفه البرنامج: يسمح بتغيير النموذج بسهولة وباستعمال نموذجين في آن واحد، فتظهر فائدة كلّ منهما. ويسمح كذلك بدراسة مفصّلة لبنية البروتين وتحديد مواقع الأحماض الأمينية داخل البنية الفراغية وربطها بها، وبتحديد الموقع الفعّال الذي يرتبط عنده الأنزيم بمادّة التفاعل.
الاستنتاج: في النموذج الشريطي تُعرف البنية الثانوية بشكلها: شريط ملتفّ للحلزونية α، وشريط مسطّح برأس سهم للوريقية β، وخيط أبيض لمناطق الانعطاف. ويسمح استعمال الحاسوب بتغيير النموذج، وبتحديد مواقع الأحماض الأمينية والموقع الفعّال للبروتين.

النشاط 3: البنية الأولية والبنية الثانوية

الوثيقة ⁦(3)⁩: البنية الأولية للبروتين، ثمّ شكلا البنية الثانوية والروابط التي تحافظ على تماسكهما.
🎯التعليمة
  1. صف البنية الأولية للبروتين، وحدّد ما ترمز إليه الكرية والخطّ في هذا التمثيل.
  2. ميّز بين البنية الحلزونية والبنية الوريقية من حيث الشكل الذي تأخذه السلسلة.
  3. حدّد نوع الروابط التي تحافظ على تماسك البنية الثانوية، وبيّن أين تقع في كلّ من الشكلين.
إظهار الإجابة
🔍التحليل
  1. نصف البنية الأولية: هي تتابع الأحماض الأمينية مرتبطة فيما بينها بروابط ببتيدية في سلسلة خطّية. ففي هذا التمثيل ترمز الكرية إلى حمض أميني ويرمز الخطّ إلى رابطة ببتيدية. والبنية الأولية ليست فيها أيّ صورة فراغية: ليس فيها إلّا الترتيب، ونلاحظ أنّ الحمض الأميني الواحد قد يتكرّر في السلسلة نفسها.
  2. نميّز بين الشكلين: البنية الحلزونية α التفاف السلسلة الببتيدية على نفسها في مناطق محدّدة فتأخذ شكل حلزون. والبنية الوريقية β انطواء السلسلة في مناطق محدّدة فتأخذ شكل الوريقة المطوية. والشكلان قد يوجدان في السلسلة الواحدة، وبينهما مناطق بينية ليس لها شكل فراغي محدّد.
  3. نحدّد الروابط وموضعها: تحافظ البنيتان على تماسكهما بروابط هيدروجينية تنشأ بين مجموعات CO ومجموعات NH العائدة إلى الروابط الببتيدية. والفرق بين الشكلين ليس في طبيعة الرابطة بل في موضعها: في الحلزون تُمدّ الروابط داخل السلسلة الواحدة بين لفّتين متتاليتين، وفي الوريقة تُمدّ بين قطعتين من السلسلة وُضعتا جنبا إلى جنب.
الاستنتاج: البنية الأولية تتابع الأحماض الأمينية مرتبطة بروابط ببتيدية، ولا شكل فراغي لها. وتنشأ عن التفافها البنية الثانوية بشكلين: حلزوني α ووريقي β، يحافظ على تماسكهما روابط هيدروجينية بين مجموعات CO و NH، تختلف مواضعها من شكل إلى آخر.
انتبه إلى ما تربطه كلّ رابطة، فهو أدقّ ما يُسأل عنه: الروابط الهيدروجينية للبنية الثانوية تنشأ بين مجموعات الرابطة الببتيدية نفسها، أي على هيكل السلسلة؛ أمّا روابط البنية الثالثية فتنشأ بين جذور R للأحماض الأمينية. مستويان مختلفان، وموقعان مختلفان للرابطة.

النشاط 4: البنية الثالثية والروابط التي تثبّتها

الوثيقة ⁦(4)⁩: البنية الثالثية للبروتين وأنواع الروابط التي تحافظ على استقرارها.
🎯التعليمة
  1. عرّف البنية الثالثية، وبيّن دور مناطق الانعطاف فيها.
  2. استخرج أنواع الروابط التي تحافظ على استقرار البنية الثالثية، وحدّد بين أيّ الأجزاء تنشأ.
  3. صنّف هذه الروابط إلى مجموعتين حسب قوّتها.
إظهار الإجابة
🔍التحليل
  1. نعرّف ونبيّن الدور: البنية الثالثية انطواء السلسلة الببتيدية التي تحتوي على بنيات ثانوية ومناطق بينية. ويحدث الانطواء على مستوى المناطق البينية، ولهذا تُسمّى مناطق الانعطاف: هي بمنزلة المفاصل التي تسمح للسلسلة بأن تنطوي فتأخذ بنية ثالثية محدّدة. وقد تجتمع في هذه البنية حلزونات ووريقات بنسب مختلفة من بروتين إلى آخر.
  2. نستخرج الروابط ومواضعها: أربعة أنواع، وكلّها تنشأ بين جذور R لا بين الروابط الببتيدية: روابط هيدروجينية بين الوظائف الكيميائية للجذور؛ وروابط شاردية أو ملحية بين مجموعة سالبة وأخرى موجبة؛ وتجاذب بين الجذور الكارهة للماء التي تتجمّع في الداخل؛ وجسور كبريتية بين جذري حمضين أمينيين من نوع Cys.
  3. نصنّف حسب القوّة: مجموعة الروابط التكافؤية القوية، وتضمّ الرابطة الكبريتية والرابطة الببتيدية؛ ومجموعة الروابط الضعيفة، وتضمّ الشاردية والهيدروجينية والكارهة للماء. فاستقرار البنية الثالثية قائم على رابطة قوية واحدة وعدد كبير من الروابط الضعيفة مجتمعة.
الاستنتاج: البنية الثالثية انطواء السلسلة ذات البنيات الثانوية على مستوى مناطق الانعطاف. ويثبّتها أربعة أنواع من الروابط تنشأ كلّها بين جذور R: هيدروجينية وشاردية وكارهة للماء، وهي ضعيفة، وجسور كبريتية بين جذري Cys، وهي تكافؤية قوية.

النشاط 5: البنية الرابعية

الوثيقة ⁦(5)⁩: البنية الرابعية للبروتين، على مثال الهيموغلوبين.
🎯التعليمة
  1. عرّف البنية الرابعية، وحدّد ما تُسمّى به كلّ سلسلة داخلها.
  2. صف بنية الهيموغلوبين من حيث عدد السلاسل وأنواعها وما تحمله.
  3. علّل لماذا تُعدّ البنية الرابعية أكثر المستويات تعقيدا.
إظهار الإجابة
🔍التحليل
  1. نعرّف ونسمّي: البنية الرابعية تجمّع سلسلتين ببتيديتين أو أكثر، لكلّ واحدة منها بنية ثالثية. وتُسمّى كلّ سلسلة ببتيدية داخل هذا التجمّع تحت وحدة. وتتماسك تحت الوحدات فيما بينها بروابط ضعيفة عادة، هيدروجينية وشاردية وكارهة للماء.
  2. نصف الهيموغلوبين: يتكوّن من أربع تحت وحدات، سلسلتين من النوع α وسلسلتين من النوع β، تتقابل كلّ سلسلتين من النوع نفسه. وتحمل كلّ تحت وحدة في قلبها مجموعة هيم واحدة، فيكون في الجزيء الواحد أربع مجموعات هيم. ومن البروتينات ذوات البنية الرابعية أيضا الأنزيم تريوز فوسفات إيزوميراز TPI، وهو من تحت وحدتين.
  3. نعلّل: لأنّ هذا المستوى يحتوي المستويات التي قبله كلّها ويزيد عليها. فكلّ تحت وحدة فيه لها بنيتها الأولية والثانوية والثالثة، ثمّ تُضاف روابط جديدة بين تحت الوحدات نفسها. وهو المستوى الوحيد الذي لا يبلغه كلّ البروتينات: فمنها ما يقف عند البنية الثالثية.
الاستنتاج: البنية الرابعية تجمّع سلسلتين ببتيديتين أو أكثر، تُسمّى كلّ واحدة منها تحت وحدة، وتتماسك فيما بينها بروابط ضعيفة. ومثالها الهيموغلوبين بأربع تحت وحدات، سلسلتين α وسلسلتين β، تحمل كلّ واحدة مجموعة هيم.

النشاط 6: مقارنة بين أربعة بروتينات شائعة

الوثيقة ⁦(6)⁩: البنية الفراغية لأربعة بروتينات شائعة.
وجه المقارنةالهيموغلوبينالأنسولينالليزوزيمالميوغلوبين
درجة التعقيدمعقّدةبسيطةمتوسّطةمتوسّطة
عدد السلاسل4211
أنواع البنيات الثانويةααα و βα
عدد البنيات الثانويةأكثر من 103من 8 إلى 10من 8 إلى 10
الوثيقة ⁦(7)⁩: مقارنة البروتينات الأربعة في أربعة معايير.
🎯التعليمة
  1. استخرج أوجه التشابه والاختلاف بين البروتينات الأربعة من حيث عدد السلاسل.
  2. حدّد البروتين الوحيد الذي يجمع بين نوعي البنيات الثانوية، والبروتين الأبسط من حيث عددها.
  3. قارن بين الليزوزيم والميوغلوبين، واستنتج هل تكفي درجة التعقيد البنيوي وحدها لتعريف بروتين.
إظهار الإجابة
🔍التحليل
  1. نستخرج التشابه والاختلاف: تشترك البروتينات الأربعة في أنّها كلّها مبنية من سلاسل ببتيدية منطوية وتحمل بنيات ثانوية. وتختلف في عدد السلاسل: للهيموغلوبين أربع سلاسل، وللأنسولين سلسلتان، أمّا الليزوزيم والميوغلوبين فلكلّ منهما سلسلة واحدة. فالهيموغلوبين ذو بنية رابعية: سلاسله الأربع تتجمّع في جزيئة واحدة.
  2. نحدّد: الليزوزيم هو الوحيد الذي يجمع بين البنيات الحلزونية α والوريقية β، أمّا الثلاثة الأخرى فليس فيها إلّا الحلزونية. والأنسولين هو الأبسط من حيث عدد البنيات الثانوية، فله ثلاث فقط، بينما لكلّ من الليزوزيم والميوغلوبين ما بين ثمانٍ وعشر، وللهيموغلوبين أكثر من عشر.
  3. نقارن ونستنتج: الليزوزيم والميوغلوبين لهما العدد نفسه من السلاسل والعدد نفسه تقريبا من البنيات الثانوية، ومع ذلك فوظيفتاهما مختلفتان تماما. وفي المقابل الهيموغلوبين والميوغلوبين متقاربان في الوظيفة ومختلفان في التعقيد. فدرجة التعقيد البنيوي لا تكفي وحدها لتعريف بروتين، وإنّما تصف مستوى تنظيمه لا غير.
الاستنتاج: تختلف البروتينات في عدد سلاسلها وفي أنواع بنياتها الثانوية وعددها. فالهيموغلوبين ذو بنية رابعية، والليزوزيم وحده يجمع بين البنيتين α و β. ولا تكفي درجة التعقيد البنيوي وحدها لتمييز وظيفة بروتين عن وظيفة آخر.

النشاط 7: مراحل انطواء السلسلة الببتيدية

تمثّل الوثيقة ⁦(8)⁩ المراحل الممكنة التي تمرّ بها سلسلة ببتيدية لتبلغ بنيتها الفراغية، ممثّلة بالنموذج الشريطي في سبع حالات متتالية تصل بينها أسهم.

الوثيقة ⁦(8)⁩: مراحل انطواء سلسلة ببتيدية، ممثّلة بالنموذج الشريطي.
🎯التعليمة
  1. صف تطوّر شكل السلسلة في الحالات السبع للوثيقة ⁦(8)⁩، من الحالة الأولى إلى الأخيرة، متتبّعا اتّجاه الأسهم.
  2. حدّد التغيّرين اللذين يحدثان معا من حالة إلى التي تليها.
  3. استنتج هل يتمّ انطواء السلسلة الببتيدية دفعة واحدة، وممّ تنتج بنيتها الفراغية النهائية.
إظهار الإجابة
🔍التحليل
  1. نصف: تنطلق السلسلة في الحالة الأولى ممدودة، في شكل حلقة كبيرة مفتوحة تكاد تخلو من أيّ التفاف. ثمّ يقلّ حجمها الكلّي من حالة إلى أخرى، حتّى تبلغ في الحالة السابعة أكثر أشكالها تراصّا وأصغرها حجما.
  2. نحدّد: من حالة إلى التي تليها يحدث تغيّران في آن واحد. تظهر على الشريط قطع قصيرة ملتفّة هي البنيات الحلزونية، ثمّ يتزايد عددها؛ وتتراصّ السلسلة كلّها بانطواء حلقاتها بعضها على بعض.
  3. نستنتج: لا يتمّ الانطواء دفعة واحدة، بل تدريجيا عبر مراحل متتالية، تظهر فيها البنيات الثانوية في الوقت الذي تتراصّ فيه السلسلة. والبنية النهائية لا تُفرض على السلسلة من الخارج، بل تنتج عن السلسلة نفسها، مرحلة بعد مرحلة.
الاستنتاج: انطواء السلسلة الببتيدية عملية تدريجية تمرّ بمراحل متتالية، تظهر فيها البنيات الثانوية وتتكاثر بينما تتراصّ السلسلة كلّها، حتّى تبلغ بنيتها الفراغية النهائية. وهذه البنية تنتج عن السلسلة نفسها، لا عن عامل خارجي.

تمثيل البنية الفراغية للبروتين

يمكن تمثيل البنية الفراغية لجزيء بسيط كالحمض الأميني بعدّة نماذج: نموذج العود، ونموذج الكرة والعود، والنموذج المكدّس. ويمكن أن يُركَّب النموذج من قطع صلبة من البلاستيك أو الخشب، أو يُنشأ على شاشة الحاسوب ببرامج محاكاة خاصّة، وهي الطريقة الأكثر استعمالا اليوم.

أمّا الجزيئات الكبيرة كالبروتينات فتحتاج، زيادة على هذه النماذج، إلى نموذج أنفع في إظهار البنيات الفراغية α و β ومناطق الانعطاف، وهو النموذج الشريطي. وفيه تُمثَّل البنية الحلزونية α شريطا حلزونيا، وتُمثَّل البنية الوريقية β شكلا مسطّحا قد يكون على هيئة سهم لتحديد الاتّجاه وتمييز الوريقات المتوازية من المتعاكسة، وتُمثَّل المناطق البينية خيطا رفيعا أبيض.

ويضيف استعمال الحاسوب إلى ذلك ما لا يتيحه النموذج المصنوع باليد: تغيير طريقة التمثيل، واستعمال نموذجين في آن واحد، ودراسة مفصّلة لبنية البروتين تسمح بتحديد مواقع الأحماض الأمينية داخل البنية الفراغية وربط موقع الحمض الأميني ببنيتها، وتحديد الموقع الفعّال الذي يرتبط عنده البروتين أو الأنزيم بمادّة التفاعل.

مستويات البنية الفراغية الأربعة

البنية الأولية هي تتابع الأحماض الأمينية مرتبطة فيما بينها بروابط ببتيدية في سلسلة خطّية؛ وليست لها صورة فراغية. والبنية الثانوية هي التفاف هذه السلسلة في مناطق محدّدة منها، فتأخذ إمّا الشكل الحلزوني α وإمّا الشكل الوريقي المطويّ β وإمّا الشكلين معا، ويحفظ تماسكها روابط هيدروجينية بين مجموعات CO و NH العائدة إلى الروابط الببتيدية.

وتبقى في السلسلة، إلى جانب البنيات الثانوية، مناطق بينية لا شكل فراغي محدّدا لها؛ وهي التي تسمح بالانتقال إلى البنية الثالثية. فالبنية الثالثية انطواء السلسلة على مستوى هذه المناطق التي تصير مناطق انعطاف، ويحفظ استقرارها أربعة أنواع من الروابط تنشأ بين جذور R: هيدروجينية، وشاردية، وتجاذب بين الجذور الكارهة للماء، وجسور كبريتية بين جذري حمضين أمينيين من نوع Cys.

ولا تبلغ السلسلة بنيتها الفراغية النهائية دفعة واحدة: فانطواؤها تدريجيّ، يمرّ بمراحل متتالية تظهر فيها البنيات الثانوية وتتكاثر، في الوقت الذي تتراصّ فيه السلسلة بانطواء حلقاتها بعضها على بعض. والشكل النهائي لا يُفرض عليها من الخارج، بل ينتج عن السلسلة نفسها، مرحلة بعد مرحلة.

والبنية الرابعية أقصى حدّ للتنظيم: هي تجمّع سلسلتين ببتيديتين أو أكثر، لكلّ واحدة بنية ثالثية، وتُسمّى كلّ سلسلة تحت وحدة. وتتماسك تحت الوحدات بروابط ضعيفة عادة. ولا يبلغ هذا المستوى إلّا قسم من البروتينات، مثل الهيموغلوبين بأربع تحت وحدات.

والعلاقة بين المستويات الأربعة علاقة تدرّج: يزداد التعقيد من الأولى الأبسط إلى الرابعية الأعقد، بازدياد عدد الأحماض الأمينية وبظهور روابط بنائية جديدة في كلّ مستوى، بداية من الهيدروجينية الأضعف إلى الكبريتية الأقوى. وكلّ مستوى يحتوي الذي قبله ولا يلغيه: فالبنية الأولية باقية داخل البنية الرابعية.

طريقة مضمونة لعدم الخلط بين المستويات في الامتحان: اسأل نفسك عن عدد السلاسل أوّلا. سلسلة واحدة ممدودة تعني بنية أولية؛ وسلسلة واحدة فيها حلزون أو وريقة تعني بنية ثانوية؛ وسلسلة واحدة منطوية كلّها تعني بنية ثالثية؛ وسلسلتان فأكثر، لكلّ منها بنية ثالثية وتتماسك بروابط ضعيفة، تعني بنية رابعية. فالعدّ قبل الوصف.
حصيلة الدرس: من تتابع الأحماض الأمينية إلى تجمّع تحت الوحدات، مستوى بعد مستوى.
في الباكالوريا لا يُطلب منك في الغالب سرد المستويات الأربعة سردا، بل التعرّف على مستوى بنية من صورة أو نموذج شريطي، أو تسمية رابطة مؤشّر عليها بسهم. تدرّب على التعرّف بالعين: شريط ملتفّ يعني حلزونا α، وشريط مسطّح برأس سهم يعني وريقة β، وخيط أبيض يعني منطقة انعطاف، وأكثر من كتلة يعني بنية رابعية.
عند المراجعة، ارسم على ورقة سلسلة من كريات ثمّ أعد رسمها ثلاث مرّات: ملتفّة، ثمّ منطوية، ثمّ مضمومة إلى سلسلة أخرى. وسمّ في كلّ مرّة الرابطة التي جعلت الانتقال ممكنا. إن استطعت تسمية الروابط الثلاث فقد استوعبت الدرس كلّه.
الخلاصة: يُمثَّل البروتين بعدّة نماذج، وأنفعها في دراسة بنيته الفراغية النموذج الشريطي لأنّه وحده يُظهر البنيات الثانوية ومناطق الانعطاف، ويزيد الحاسوب على ذلك تحديد مواقع الأحماض الأمينية والموقع الفعّال. وللبنية الفراغية أربعة مستويات متدرّجة التعقيد: بنية أولية هي تتابع الأحماض الأمينية بروابط ببتيدية؛ وبنية ثانوية هي التفافها حلزونيا α أو وريقيا β بروابط هيدروجينية بين CO و NH؛ وبنية ثالثية هي انطواؤها عند مناطق الانعطاف بأربعة أنواع من الروابط بين جذور R؛ وبنية رابعية هي تجمّع تحت وحدتين أو أكثر بروابط ضعيفة، كما في الهيموغلوبين ذي السلسلتين α والسلسلتين β.

Page 1/10

© Madrassati — leçon rédigée par Madrassati · madrassati.net